阿賴耶識了別眾生根身器界,因為阿賴耶識裡有七大種子,還有眾生的業種,業種存在阿賴耶識裡,阿賴耶識能了知到,知道業種是否成熟,什麼時候成熟。然後輸送七大種子,造眾生的五陰,祂了別五陰業種,一定知道眾生應該有什麼樣的五陰,才能如實地變造五陰。變造出來以後,五陰的一切情況,阿賴耶識都知道,因為祂時刻維繫著五陰色身,不斷地輸送和改變種子,色身才能相續存在,並且不斷地發展變化。器世間是所有眾生的阿賴耶識共同變造的,所有的阿賴耶識都了別自體裡的器世間的業種,才能輸送四大種子變造出宇宙器世間,之後還要共同維持器世間,讓器世間能夠生住異滅。
阿賴耶識了別根身器界,才能知道如何變造,否則就沒辦法變造,祂不是隨意亂造,一定有個規律和原則,祂是按照因果律則來變造和執持一切法。變造身體以後,仍然要了別身體,知道該怎樣變化,就讓身體怎樣變化,都是根據因果律則,法爾如是地運行。祂不是像六識那樣,對五陰身,對器世間有各種名詞概念,知道具體情況如何,祂沒有這種了別性,不會作具體了別。
祂也沒有分析思惟判斷的功能作用,祂的知性,完全不同於六識的知。我們每天吃的飲食,祂攝取其中的四大成分,用來再變造身體,祂知道攝取多少,知道怎樣變造。業不同的眾生,雖然飲食一樣,生活環境一樣,可是身體卻是不一樣,就是因為業力不一樣,阿賴耶識變造的就不一樣。
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