清淨四大有生成義，能生成物質色法，物質色法是被如來藏生成的，依眾生的業緣而生起，生滅變異。具體還是三能變識和合運作的結果，不完全由如來藏當中的業種決定，也有後天因素，後天因素就離不開意根和意識。比如說如果意識活在世間，處處不如意，就會感到世間百般無聊，意根了知以後就可能有不想活的想法，於是有可能想辦法自殺。意識如果不在意色身，意根就會決定不給自己加強營養，於是色身就會羸弱。意根和意識的意念可以指揮一切，改變一切，我們的意念力強，也可以改變外界的事物。