根据十二因缘流转生死的原因，是因为意根有无明就以无明为缘产生了意根无明的行，以意根无明的行为缘就产生了六识无明的身口意行，身口意行落谢在阿赖耶识里成为种子。意根的行也就是意根的抉择行为，意根抉择之后就会有六识出生辅助意根造作，所以如果意根染污有无明，作为助手的六识就要辅助意根造作染污业行。如果意根虽然有染污，在不抉择染污行的时候，意识可以依靠自身的清净熏染意根的心，意根也许可意识的清净行，那么就会产生清净的业行。所以修行就是要熏习善法，并且以此善法熏染意根，从而破除意根的无明，改变意根，心就清净了，将来就会有清净的果德可受用。